Werner Hoyer har stået for en betydelig udvidelse og transformering af Banken. Et af de mest bemærkelsesværdige resultater under hans formandskab er Den Europæiske Fond for Strategiske Investeringer, et helt centralt initiativ til at fremme jobskabelse og økonomisk vækst i EU.
Under Werner Hoyers ledelse har EIB også konsolideret sin stilling som den førende multilaterale långiver på verdensplan inden for klimafinansiering. I 2019 skabte EIB global præcedens i kampen mod klimaforandringer ved at meddele, at dens finansiering af energiprojekter, der vedrører fossile brændstoffer, ophører fra udgangen af 2021, og at den vil støtte investeringer i klimatiltag og miljømæssig bæredygtighed med 1 billion EUR i de næste ti år frem til 2030.