W celu zachowania przejrzystości skargi uznaje się za niepoufne. Niepoufny charakter skarg oznacza, że Grupa EBI ma zezwolenie na ujawnienie informacji przekazywanych we wszelkich oświadczeniach dla zainteresowanych stron zewnętrznych i wewnętrznych w celu rozpatrzenia skargi. Jednakże skarżący mają prawo wskazania w treści pisma, że ich skargę należy traktować jako poufną. Skarżących prosi się o wyraźne wskazanie, czy życzą sobie, aby ich skarga miała poufny charakter.
Skargi mogą zawierać dane osobowe dotyczące skarżącego lub osób trzecich. Przetwarzanie danych osobowych przez EBI podlega przepisom rozporządzenia (WE) nr 45/2001. W wypadku skarżących, którzy zrzekli się prawa do poufności, przyjmuje się, że wyrazili oni zgodę - do celów artykułu 5 (d) rozporządzenia (WE) nr 45/2001 - na publikowanie przez EBI wszelkich danych osobowych zawartych w skardze.
Dostęp do informacji dotyczących wszelkich dokumentów związanych ze skargą podlega zasadom polityki publicznego ujawniania informacji EBI.