W celu zabezpieczenia interesów skarżących skargi składane w ramach wewnętrznego systemu rozpatrywania skarg EBI są traktowane jako poufne, chyba że skarżący zażyczy sobie inaczej. Skargi, dla których skarżący zrzekł się prawa do poufności, są publikowane na stronie internetowej EBI wraz ze sprawozdaniem zawierającym wnioski Biura ds. Skarg EBI.

Skargi mogą zawierać dane osobowe dotyczące skarżącego lub osób trzecich. Przetwarzanie danych osobowych przez EBI podlega przepisom rozporządzenia (WE) nr 45/2001. W wypadku skarżących, którzy zrzekli się prawa do poufności, przyjmuje się, że wyrazili oni zgodę - do celów artykułu 5 (d) rozporządzenia (WE) nr 45/2001 - na publikowanie przez EBI wszelkich danych osobowych zawartych w skardze.

Dostęp do informacji dotyczących wszelkich dokumentów związanych ze skargą podlega zasadom polityki publicznego ujawniania informacji EBI.