Id-dipartimenti tal-Bank:
- jevalwaw, jivvalutaw u jiffinanzjaw proġetti,
- jiġġeneraw riżorsi fis-swieq kapitali u jimmaniġġjaw it-teżor,
- jivvalutaw u jimmaniġġjaw ir-riskji marbuta mal-attivitajiet tal-BEI,
- imexxu l-istudji ekonomiċi jew finanzjarji neċessarji fl-isfond.
Filwaqt li jaħdmu ma' timijiet multidixxiplinari, huma jħejju u jimplimentaw id-deċiżjonijiet tat-tmexxija tal-Bank.
L-istruttura tal-organizzazzjoni tal-BEI tikkonsisti fid-Direttorati u d-Dipartimenti li ġejjin: